細胞STR鑒定技術服務

    研究背景

    細胞系錯誤鑒定問題已有50年歷史，基于國際細胞庫的分析數(shù)據顯示：1984年細胞錯誤鑒定率為35%，1999年為18%，直到最近幾年，應用于生物醫(yī)學領域的細胞系需要鑒定的問題仍然很少有人關注。

    近年來，大量研究表明 STR 基因分型 方法是進行細胞交叉污染和性質鑒定的最有效和準確的方法之一，STR基因分型應用于細胞鑒定已被ATCC等機構強烈推薦。美國的ATCC 細胞庫、德國的DSMZ細胞庫以及日本的JCRB細胞庫等為STR 分型提供了各細胞株的數(shù)據供比對。

    技術簡介

    STR ( Short Tandem Repeat, 短串聯(lián)重復序列)基因分型技術是細胞身份鑒定最準確有效的方法，被ATCC、ICLAC等權威機構認定為細胞鑒定的金標準。STR基因位點由長度為3~ 7個堿基對的短串連重復序列組成，廣泛存在于人類基因組中，被稱為細胞的DNA指紋。通過對這些STR位點的檢測，將檢查結果與專業(yè)的STR數(shù)據庫比對，從而確定被測細胞的真實身份，或判斷被測細胞是否與某些細胞，發(fā)生交叉污染。

    人源細胞STR分型(cell line STR genotyping),是選用D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、D6S1043、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、PentaD、vWA、D8S1179、TPOX、PentaE、TH01、D12S391、D2S1338和FGA等19個具有高度多態(tài)性基因座和一個性別基因位點Amelogenin對人源細胞進行STR分型檢測。根據STR分型結果對細胞的生長狀態(tài)(是否存在交叉污染)和細胞的株系進行確認的技術手段。

    為什么需要做細胞STR鑒定

細胞系錯誤鑒定所造成的后果

    ? 細胞系的損失

    ? 時間和金錢的損失

    ? 在公眾領域(文獻、專利等)提供錯誤信息

    ? 造成實驗結果不一致或不可重復

何時需做細胞STR鑒定

    ?發(fā)表文章或申請課題經費前

    ?使用細胞進行臨床治療(試驗)前

    ?準備凍存保種或已凍存多年的細胞

    ?一個涉及到細胞試驗項目開始/結束時

    ?新得到的細胞或實驗室傳5代以上的細胞

    ?細胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結果與預期差別較大

    ?文章發(fā)表或常規(guī)定期鑒定

    周期報價

    周期：1 周

    報價：800 元/樣

    檢測流程

    1.確定STR位點，設計實驗方案，包括熒光標記的選擇，引物的設計、合成和標記，熒光分子量內標的選用等。

    2.按照所設計的實驗方案完成熒光PCR，利用瓊脂糖電泳檢測結果;若PCR產物特異性不夠，將進行優(yōu)化。

    3.PCR產物通過ABI 3730XL測序儀器進行毛細管電泳檢測，獲得擴增片段大小的數(shù)據

    4.用GeneScan 3.0/GenoTyper 2.0或GeneMapper 3.2等軟件對收集到的數(shù)據進行處理分析，將產物片段大小、數(shù)量多少的信息轉化成直觀準確的波形圖譜，為下一步進行關聯(lián)分析或連鎖分析等遺傳分析提供可靠的數(shù)據。

    服務內容

    細胞收集，基因組DNA提取

    熒光弓|物PCR擴增21個str位點

    產物經測序儀電泳，獲得細胞基因分型結果

    結果與ATCC、DSMZ、JCRB和RIKEN等細胞庫比對和分析

    樣品要求

    1. PCR產物或基因組DNA：濃度≥200ng/ul，總體積≥20ul，OD260/280在1.7至2.0之間;新鮮組織樣品：總量≥100mg的新鮮組織樣品或1～2ml血液樣品

    2. PCR產物或基因組DNA請?zhí)峁悠返碾娪緳z測圖

    3. 由于在實驗過程中，可能會出現(xiàn)某些STR位點難以檢測的情況，建議提供3～4個備選STR位點

    4. 建議使用6FAM, VIC, NED以及PET四種熒光標記

    5. 為盡量避免多種熒光信號的相互干擾，不建議同管檢測使用的熒光多于2種，多種熒光同管檢測，PCR產物大小需相差50bp以上

    6. STR檢測中常會出現(xiàn)一些比正常產物短2～4個堿基的峰，這是由截斷PCR造成的，屬于正?，F(xiàn)象，并不會影響實驗結果的分析。

    您的細胞系認證服務 STR 概況報告包含

    簡單易懂的STR等位基因表

    支持每個位點的等位基因調用的電泳圖

    結果的綜合解釋

    STR 分型圖譜和細胞鑒定結果的書面報告 (中英文報告)

    公司優(yōu)勢

    通用熒光引物，大幅降低3730實驗成本

    提供21個str位點選擇，極大提高鑒定的分辨率

    數(shù)據分析基于3730測序平臺，結果穩(wěn)定可靠

    可提供英文報告，用于文章發(fā)表

    實驗周期短，價格優(yōu)惠，售后服務完善

    項目案例

    STR鑒定應用

    STR分析已廣泛應用于遺傳制圖、連鎖性分析、親子鑒定、疾病基因定位和物種多態(tài)性研究等諸多領域。高度多態(tài)的微衛(wèi)星還可以用來在人群進行個體識別。刑事案件的偵破離不開法醫(yī)學的幫助,其中Y-STR檢測手段在鑒定中發(fā)揮的作用尤為突出。

    Y-STR檢驗是法醫(yī)學對精子的一種DNA檢測手段，Y-STR基因座是位于男性Y染色體上的人類多態(tài)性STR位點，一般情況下，只有男性個體才有Y染色體，因此，Y-S T R具有男性遺傳，男性特異性的特點。Y-S T R即可作為性別鑒定的依據，同時在法醫(yī)學精斑及混合斑檢驗中發(fā)揮著重要作用。Y染色體為男性個體特有且呈現(xiàn)男性伴性遺傳,Y-STR檢測技術可以對嫌疑人或被害人的身份認定進行有效確認,故作為一種補充檢驗技術,此項技術在個體識別、親子鑒定、血緣關系鑒定及族譜DNA分析等方面具有十分重要的研究和應用價值。